编者按：欢迎阅读「给每个人的 Linux 桌面入门指南」系列，这个系列将持续更新，希望可以帮你改变「用 Linux 很复杂」的印象，给你多一种操作系统的可选项。本篇是这个系列第四篇，重点阐述生产预置 Linux 系统的电脑制造商和一些有意思的 Linux 个人设备。

本教程这一部分介绍创建sander输入文件所需要的AMBER程序/工具, sander将使用它们执行非标准残基的能量最小化和分子动力学模拟. 本节采用的主要程序是LEAP: 它是一个读入力场, 拓扑结构和坐标信息, 并生成正式计算(即能量最小化, 分子动力学, 分析...)所需文件的程序 ...

之前讲了如何用 gnuplot 进行数据绘图。实验中经常碰到的情况是，我们要同时处理多组数据。这一次我们来讲一讲，怎样把多组数据绘制到同一个图上。 还拿城市降水量举例，下面是我们的数据文件，文件名是“precipitation.dat”： 我们在 gnuplot 里面执行下面的 ...

CFDEM软件的安装主要包含 OpenFoam的编译，LIGGGHTS的编译，以及CFDEMCoupling的编译。 要想这三个的编译成功来说还是有点繁琐，需要另外注意的是版本的配对问题。常见问题还包括集群的mpi配置问题。 我这里是在自己的笔记本上安装。由于笔记本计较老，装的系统是 ...